engleski

Analysis of satellite DNAs in the sequenced genome of Tribolium castaneum (Coleoptera)

Nedavno je sekvenciran genom kukca, Tribolium castaneum, te je napravljeno prvo kompletiranje sekvenci koje predstavljaju oko 70% genoma. Smatra se da ˝nepoznati” dio genoma uglavnom čine ponavljajuće sekvence DNA koje ne mogu biti sastavljene automatskom analizom. In silico analiza udjela i rasporeda ponavljajućih sljedova DNA u do sada složenom genomu pokazala je da otprilike 30% čine ponavljajuće DNA (Wang et al, Genome Biology 2008, 9:R61), od čega samo 2, 5% otpada na satelitnu DNA. Ovaj rezultat nije u skladu s eksperimentalnim podacima koji pokazuju da (peri)centromerna satelitna DNA s duljinom monomera od 360 pb (360-satDNA) ima vrlo visok udio u genomu od čak 17%. Predstaviti ćemo naše rezultate in silico i eksperimentalnih analiza novootkrivenih satelitnih DNA iz reptig datoteka koje nisu mogle biti složene u genom. Nadalje, prikazati ćemo sveobuhvatnu analizu prije opisane 360-satDNA u sekvenciranom genomu.

genome; satellite DNA

nije evidentirano