hrvatski

Otkriće nove varijante papiloma virusa čovjeka tipa 16

Genom tipa 16 papiloma virusa čovjeka (HPV, od engl. Human papillomavirus) detaljno je istraživan, no o genu E1 nije bilo mnogo studija. Gen E1 bitan je za replikaciju virusne DNK. Prilikom analize regije E1 u 429 obrisaka vrata maternice pozitivnih na HPV 16, nađeno je 11.2% uzoraka koji sadrže duplikaciju od 63 nukleotida. Određivanje sekvence i analiza regija E6 i E7 virusnog genoma, pokazalo je da svi uzorci koji sadržavaju duplikaciju također imaju još i mutaciju G350. In silico prevođenje sekvence gena E1 koji sadrži istu duplikaciju, ukazuje da nastaje promijenjeni protein povećan za 21 aminokiselinu. Regija proteina E1 u kojoj se dogodila duplikacija trenutno nema određenu funkciju iako se smatra da je potrebna za optimalnu aktivnost proteina u in vivo uvjetima. Nađena je statistički značajna razlika (p=0.04) u zastupljenosti oštećenja vrata maternice visokog stupnja između skupina uzoraka sa i bez duplikacije ; skupina uzoraka sa duplikacijom manje je povezana sa teškim promjenama, što otvara pitanje da li ova duplikacija može smanjiti onkogeni potencijal HPV-a tipa 16. Ujedno, ova opažanja mogla bi objasniti razliku primijećenu u ponašanju varijante HPV-a tipa 16 sa mutacijom G350 ; ta mutacija je u nekim Europskim zemljama povezana sa većom onkogenošću virusa, dok u drugim zemljama ta veza nije zapažena. Daljnja istraživanja potrebna su da se razjasni značaj ove nove varijante sa duplikacijom u genu E1 HPV-a tipa 16 te njene biološke važnosti.

Humani papiloma virus (HPV); varijant; gen E1

The Human papillomavirus (HPV) 16 genome has been extensively studied, although no study has focused on the E1 gene that is implicated in viral DNA replication. After analyzing the E1 region of HPV 16 genomes in 429 cervical specimens, 11.2% were found to contain 63-nucleotides duplication in this region. Sequence analysis of the E6 and the E7 regions has shown that all samples containing this duplication were related to G350 variant of the HPV 16. In silico translation of the E1 gene with the duplication has shown that the protein has extra 21 amino acids as the duplication is “ in frame” and does not introduce a premature stop codon. The affected region has currently no significant function ascribed to it. However, comparison of cervical lesion severity of the examinees having normal or variant E1 genes has shown that the variant group is significantly (p=0.04) less associated to high grade cervical lesions, suggesting that this particular duplication might reduce the oncogenic potential of HPV 16, and also might clarify the differences of G350 variant oncogenicity observed in European populations. Further research is needed to elucidate the biology of these HPV 16 E1