Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Proučavanje međudjelovanja proteina korištenjem računala (CROSBI ID 531830)

Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa

Tomić, Sanja Proučavanje međudjelovanja proteina korištenjem računala // Knjiga sažetaka 5. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva. Zagreb, 2007. str. 56-x

Podaci o odgovornosti

Tomić, Sanja

hrvatski

Proučavanje međudjelovanja proteina korištenjem računala

Većina staničnih procesa zasniva se na međudjelovanju proteina. Predmet naših istraživanja su kompleksi Ras proteina s njegovim efektorima Raf i RalGDS1 , te Barnase-Barstar kompleks2. Ras je prisutan u nizu staničnih procesa gdje služi kao molekularna sklopka. Neke njegove mutacije rezultiraju poremećajima u stanicama, pa ne čudi što su mutanti Ras proteina nađeni kod velikog broja tumora. Barnase je izvanstanična ribonukleaza, a Barstar je njezin stanični inhibitor. Njihov kompleks je jedan od najčvršćih proteinskih kompleksa s konstantom disocijacije oko 10-14M. Odredili smo prirodu najznačajnijih interakcija u navedenim kompleksima te utjecaj točkastih mutacija na njihovu stabilnost. Elektrostatske doprinose nastajanju kompleksa izračunali smo korištenjem Poisson-Boltzmann-ovog pristupa konačnih razlika a primjenom Brown-ove dinamike procijenili smo utjecaj mutacija na brzinu kompleksiranja. Izgradili smo QSAR (Quantitative Structure Activity Relationship) modele za predviđanje slobodne energije vezanja. 1. Tomić S., Bertoša B., Wang T., Wade C. R., PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics, 67 (2007), 435-447. 2. Wang T., Tomić S., Gabdouline R. R., Wade C. R., Biophysical J. 87 (2004), 1618-1630.

proteini; međudjelovanje; modeliranje

nije evidentirano

engleski

Study of interactions among proteins by computer

nije evidentirano

proteins; intaractions; modelling

nije evidentirano

Podaci o prilogu

56-x.

2007.

objavljeno

Podaci o matičnoj publikaciji

Knjiga sažetaka 5. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva

Zagreb:

978-953-7178-10-9

Podaci o skupu

5. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva

poster

01.01.2007-01.01.2007

Primošten, Hrvatska

Povezanost rada

Fizika