Proučavanje međudjelovanja proteina korištenjem računala (CROSBI ID 531830)
Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa
Podaci o odgovornosti
Tomić, Sanja
hrvatski
Proučavanje međudjelovanja proteina korištenjem računala
Većina staničnih procesa zasniva se na međudjelovanju proteina. Predmet naših istraživanja su kompleksi Ras proteina s njegovim efektorima Raf i RalGDS1 , te Barnase-Barstar kompleks2. Ras je prisutan u nizu staničnih procesa gdje služi kao molekularna sklopka. Neke njegove mutacije rezultiraju poremećajima u stanicama, pa ne čudi što su mutanti Ras proteina nađeni kod velikog broja tumora. Barnase je izvanstanična ribonukleaza, a Barstar je njezin stanični inhibitor. Njihov kompleks je jedan od najčvršćih proteinskih kompleksa s konstantom disocijacije oko 10-14M. Odredili smo prirodu najznačajnijih interakcija u navedenim kompleksima te utjecaj točkastih mutacija na njihovu stabilnost. Elektrostatske doprinose nastajanju kompleksa izračunali smo korištenjem Poisson-Boltzmann-ovog pristupa konačnih razlika a primjenom Brown-ove dinamike procijenili smo utjecaj mutacija na brzinu kompleksiranja. Izgradili smo QSAR (Quantitative Structure Activity Relationship) modele za predviđanje slobodne energije vezanja. 1. Tomić S., Bertoša B., Wang T., Wade C. R., PROTEINS: Structure, Function, and Bioinformatics, 67 (2007), 435-447. 2. Wang T., Tomić S., Gabdouline R. R., Wade C. R., Biophysical J. 87 (2004), 1618-1630.
proteini; međudjelovanje; modeliranje
nije evidentirano
engleski
Study of interactions among proteins by computer
nije evidentirano
proteins; intaractions; modelling
nije evidentirano
Podaci o prilogu
56-x.
2007.
objavljeno
Podaci o matičnoj publikaciji
Knjiga sažetaka 5. znanstvenog sastanka Hrvatskog fizikalnog društva
Zagreb:
978-953-7178-10-9
Podaci o skupu
5. znanstveni sastanak Hrvatskog fizikalnog društva
poster
01.01.2007-01.01.2007
Primošten, Hrvatska