Strukturna analiza derivata oleandomicina i interakcija s ribosomom spektroskopijom NMR i molekulskim modeliranjem (CROSBI ID 347311)
Ocjenski rad | doktorska disertacija
Podaci o odgovornosti
Tepeš, Predrag
Novak, Predrag
hrvatski
Strukturna analiza derivata oleandomicina i interakcija s ribosomom spektroskopijom NMR i molekulskim modeliranjem
Konformacijska analiza oleandomicina i njegovih derivata u otopini CDCl3 , DMSO-d6 , aceton-d3 i fosfatni/TRIS pufer određena je uz pomoć metoda i tehnika spektroskopije NMR. Analizirane su homonuklearne vicinalne konstante sprega H2, H3 i NOE/ROE kontakti, te su uspoređeni s literaturno dostupnim konformacijskim analizama strukturno sličnih makrolidnih spojeva. Makrociklički laktonski prsten može poprimiti dvije konformacije – „ folded-in“ i „ folded-out“ . Utvrđeno je da su konformacije svh istraživanih spojeva smjese „ folded-in“ i „ folded-out“ konformacijskih familija, sa većim udjelom „ folded-out“ konformera. Također ispitana je temperaturna ovisnost udjela konformacijskih familija, te ovisnost o dielektričnoj konstanti otapala. Konformacije makrociklikog laktonskog prstena potvrđene su i računima molekulskog modeliranja. Desozamin i oleandroza zaprimaju uobiajenu „ Everett-Tyler“ konformaciju stolice. Pokazano je da šećeri imaju više konformacijske slobode oko glikozidne veze od srodnih šećera u strukturno sličnim makrolidima. Istražena je i aktivna konformacija oleandomicinskih spojeva u kompleksu s ribosomom E.Coli pomoću trNOESY i STD NMR tehnika. Nađene su tri regije odgovorne za vezanje: desozamin, C3-C6 i C10-C14 regija.
interakcija; konformacija; makrolidi; molekulsko modeliranje; ribosom; spektroskopija NMR
nije evidentirano
engleski
Structural analysis of oleandomycine derivatives and interaction with ribosome by NMR spectroscopy and molecular modelling
nije evidentirano
conformation; interaction; macrolides; molecular modelling; NMR spectroscopy
nije evidentirano
Podaci o izdanju
98
17.07.2007.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb