hrvatski

Procjena polimorfizma mikrosatelitskih (SSR) DNA markera i genetske sličnosti sorata soje

Mikrosateliti, ili još "kratki ponavljajući motivi" (eng. Simple Sequence Repeats - SSRs), široko su prihvaćeni kao korisni i informativni genetski markeri kod biljaka i životinja. Korisnost mikrosatelita kao genetskih markera proizlazi iz njihove visoke polimorfnosti i kodominantnog nasljeđivanja što ih čini idealnim markerima u sudskoj medicini, analizama roditeljstva, mapiranju gena, oplemenjivanju bilja, konzervacijskoj biologiji i populacijskoj genetici. Kod soje, mikrosateliti vrlo često imaju više od 8 alela po lokusu što čini vrlo izglednim da će pojedini lokus biti polimorfan i u slučajevima križanja elitnog adaptiranog materijala. Zbog visokog stupnja polimorfizma i kodominantnog nasljeđivanja ovi markeri su vrlo prikladni za izradu "jedinstvenih genetskih profila" sorata soje i analizu pedigreea. U ovom istraživanju korišteno je 12 SSR markera za genotipiziranje 25 genotipova (sorata) soje. Analizirani genotipovi predstavljaju nekoliko nezavisnih oplemenjivačkih izvora iz Hrvatske i inozemstva. Cilj ovog istraživanja je analizirati polimorfizam alela na 12 SSR lokusa i procijeniti njihovu sposobnost za razlikovanje sorata, kao i procijeniti genetsku sličnost između 25 analiziranih genotipova uz pomoć koeficijenata genetske sličličnosti i UPGMA cluster analize. Prosječni broj alela bio je 3, 82 u rasponu od 2 do 6 po lokusu. Ovih 12 lokusa bilo je dovoljno za pouzdanu karakterizaciju svake sorte. Rezultati grupiranja uz pomoć koeficijenata genetske sličnosti u pravlu su bili u skladu sa poznatim pedigreima, iako u nekoliko slučajeva ima neočekivanih odstupanja.

soja; DNA markeri; genetska sličnost; polimorfizam alela

nije evidentirano