Naslov
Značenje integracije humanog papilomavirusa unutar genoma u nastanku raka vrata maternice
(Significance of human papillomavirus integration in the genome in the development of cervical cancer)

Autori
Matovina, Mihaela

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Ocjenski radovi, doktorska disertacija

Fakultet
Prirodoslovno-matematički fakultet

Mjesto
Zagreb

Datum
30.05

Godina
2006

Stranica
124

Mentor
Grce, Magdalena

Ključne riječi
HPV 16; integracija; rak vrata maternice
(HPV 16; integration; cervical cancer)

Sažetak
Integracija DNA HPV-a unutar staničnog genoma smatra se jednim od ključnih događaja u nastanku trajne virusne infekcije i razvoju raka vrata maternice. Cilj našeg istraživanja je bio odrediti udio integriranih oblika DNA HPV 16 u uzorcima različitog stupnja citoloških promjena te odrediti mjesta integracije unutar staničnog genoma. Za određivanje fizičkog stanja genoma HPV 16 u stanici korištene su tri, na PCR-u temeljene metode: (1) M-PCR, umnažanje dijelova regija E1 i E2 genoma HPV 16 (često se gube tijekom integracije), (2) DIPS-PCR, ligacijom posredovana metoda PCR za detekciju integriranih virusnih sekvenci, i (3) APOT, metoda umnažanja onkogenih transkripata E6 i E7 HPV 16. Osim toga, metode DIPS-PCR i APOT su nam omogućile određivanje mjesta integracije virusne DNA unutar staničnog genoma. Korištenjem metode M-PCR nađena je nova duplikacija unutar gena E1 (nt. 1312 do 1374 genoma HPV 16R) u 11.9% (21/176) uzoraka. Značenje te duplikacije trebalo bi biti razjašnjeno daljnjim istraživanjima. Kombinacijom metoda DIPS-PCR i M-PCR integrirani oblici DNA HPV 16 nađeni su u 7, 4 % (13/176) uzoraka. U 32 uzorka niskog stupnja promjena epitela vrata maternice (LSIL, tj. CIN I) nisu nađeni integrirani oblici DNA HPV 16, dok su u uzorcima visokog stupnja promjena (HSIL) integrirani oblici DNA HPV 16 nađeni u 12, 8% (6/47) CIN II, odnosno 13% (6/46) CIN III uzoraka. U jednom od 52 (2%) uzorka sa nepoznatom citološkom dijagnozom također je nađen integrirani oblik virusne DNA. Integrirani oblici su statistički značajno češće (p<0, 05) nađeni u uzorcima sa citološkom dijagnozom HSIL u odnosu na LSIL. Mjesto integracije virusne DNA unutar staničnog genoma je metodom DIPS-PCR određeno u 11 uzoraka. Naši rezultati potvrđuju nasumičnost integracije. Međutim, u 7 od 11 (63, 6%) slučajeva DNA HPV 16 bila je integrirana u fragilnim mjestima u genomu, a u 6 od 11 (54, 5%) slučajeva bila je integrirana unutar jednog od staničnih gena, VMP1, CHERP, CEACAM5, PVRL1, ARID5B i AHR, Integracija unutar gena VMP1 je također nađena u jednom uzorku analiziranom metodom APOT. Na kraju možemo zaključiti da naši rezultati potvrđuju da je integracija DNA HPV 16 pouzdan biljeg progresije neoplastičnih promjena vrata maternice te da su fragilna mjesta u genomu, ali također i genske regije, preferirana mjesta virusne integracije.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Biologija, Temeljne medicinske znanosti

POVEZANOST RADA