engleski

Use of amino acid attributes in prediction of transmembrane segments in integral membrane proteins

Algoritam SPLIT odabire najbolji model između predviđanja dobijenih korištenjem većeg broja ljestvica svojstava aminokiselinskih ostataka. Odabir najboljeg modela uključuje "Positive-Inside-Rule", motive bazičnih aminokiselina te dodatna pravila uvedena u procesu optimizacije. Objektivna usporedba algoritma s drugim poslužiteljima pokazala je da je SPLIT 4.0 u samom vrhu skupine najboljih prediktora u svijetu, kada se radi o predviđanju sekventnog položaja i transmembranske orijentacije uzvojnica u integralnim membranskim proteinima.

transmembrane helix; secondary structure prediction; membrane proteins; preference functions

nije evidentirano