hrvatski

Microarray analiza četiri planocelularna karcinoma grkljana čovjeka

Tehnologija nanošenja kratkih odsječaka gena na sintetičke podloge, DNA čip, revolucionarizirala je sva područja genetike. Ne postoji područje istraživanja u molekularnoj medicini u kojem ova metoda nije primjenjiva. Još je donedavno bilo nezamislivo da bi se većina transkripata u odabranom biološkom materijalu mogla analizirati istovremeno, u vrlo kratkom vremenu. Uvođenje tehnologije DNA čipa omogućilo je da se, ovisno o broju oligonukleotida na čipu i kvaliteti programa za analizu podataka, jednim pokusom analizira ispoljavanje dvadesetak tisuća gena. Cilj rada: Usporediti obrasce ispoljenih gena u četiri zloćudna planocelularna karcinoma grkljana (2 + 2) čovjeka koji su se razlikovali s obzirom na prisustvo bakterije H. pylori. Metode: Prisustvo H. pylori u analiziranim uzorcima utvrđeno je metodom nested PCR i rutinskom histologijom. Ukupna RNA prepisana je u cDNA a potom je, tijekom ponovnog prepisivanja u cRNA, obilježena biotinom. Fragmentirani odsječci obilježene cRNA hibridizirani su s probama na DNA čipu U-133A, Affymetrix. Rezultati: Usporedba dobivenih rezultata napravljena je korištenjem odgovarajućih programa. Križnom usporedbom dokazan je značajan (najmanje dvostruko) porast aktivnosti za 115 gena, (između ostalih, i gena koji kodiraju neke tipove kolagena), dok je znatno smanjena aktivnost dokazana za 209 gena (velik broj gena iz obitelji mucina.) Zaključak: Iako je prisustvo bakterije H. pylori u zloćudnim tumorima grkljana čovjeka povezano sa značajnom promjenom ispoljavanja velikog broja gena, primijećen je utjecaj na pojedine skupine (“ clusters” ) gena. Pravi značaj većine dobivenih rezultata na našem uzorku nije moguće objasniti na temelju dosadašnjih znanstvenih spoznaja.

karcinom grkljana;

nije evidentirano