hrvatski

Genomi školjkaša ukazuju na transpozicijsku mobilnost satelitnih ponavljanja

Satelitna DNA (satDNA) i transponirajući elementi (TE) čine dvije najznačajnije grupe ponovljene DNA u eukariotskim genomima. S obzirom na nedostatak informacija o DNA sekvencama koje okružuju nizove satDNA, naš je cilj bio istražiti sekvence vezane za satelitna ponavljanja koristeći se školjkašima kao modelnim organizmima. Asemblirani genom kamenice Crassostrea gigas (Zhang et al. 2012) pretražen je na sekvence koje okružuju njezinu satDNA Cg170 (Clabby et al. 1996). Također, u tri druge vrste školjkaša (Ruditapes decussatus, R. philippinarum i Donax trunculus) eksperimentalnim pristupom dobivene su sekvence nekoliko ranije opisanih satDNA i njihovih okruženja. Nekoliko fragmenata je nasumično odabrano i detaljno opisano. Dobiveni rezultati pokazuju da se TE‐slične sekvence (naročito DNA transpozoni) nalaze u blizini satDNA te ukazuju da je intenzivno širenje satDNA sekvenci u genomu vjerojatno uzrokovano procesima koji su vezani za transpoziciju. Navedeno promiče satDNA u vrlo dinamične sekvence koje bi mogle predstavljati građevne jedinice genoma na sličan način te usporedivog značaja kao što su to TE. Stoga, iako se tradicionalno smatraju dvjema odvojenim grupama, satDNA i TE se vrlo vjerojatno intimno isprepliću u procesu širenja po genomu, mnogo više nego što se to dosad smatralo.

satelitna DNA, transponirajući elementi, okruženja uzastopnih ponavljanja, školjkaši

nije evidentirano