Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli (CROSBI ID 458892)
Ocjenski rad | doktorska disertacija
Podaci o odgovornosti
Damjan Mitić
Ivančić Baće, Ivana
hrvatski
Mehanizmi regulacije sustava CRISPR-Cas u bakteriji Escherichia coli
Sustav CRISPR-Cas je adaptivni imunosni sustav za obranu prokariota od stranih genetičkih elemenata. Regulacija sustava CRISPR-Cas u bakteriji E. coli je kompleksna i nije u potpunosti razjašnjena. Poznato je da protein H-NS djeluje na razini transkripcije, šaperon HtpG na razini post-translacije, dok temperatura utječe na aktivnost proteina Cas3 na nepoznati način. U ovom radu su detaljnije istraženi mehanizmi regulacije aktivnosti sustava CRISPR-Cas na razini transkripcije i post-translacije. Praćenjem otpornosti stanica na infekciju fagom λvir i određivanjem količine transkripata gena cas utvrđeno je da protein StpA može inhibirati promotore Pcas8e i anti-Pcas u nedostatku proteina H-NS, te da pojačana ekspresija ili inaktivacija proteaze Lon u mutantu hns aktivira zaštitu od infekcije neovisno o sustavu CRISPR-Cas. Na aktivnost proteina Cas3 utječe ''anti-sense'' mRNA na nepoznat način, dok temperatura uzrokuje alosteričku promjenu konformacije kojom se inhibira nukleazna aktivnost. Šaperon HtpG nije utjecao na količine proteina Cas3, već vjerojatno zauzimanje njegove pravilne konformacije.
E. coli, CRISPR-Cas, Cas3, StpA, HtpG, Lon
nije evidentirano
engleski
Mechanisms regulating the CRISPR-Cas system in Echerichia coli
nije evidentirano
E. coli, CRISPR-Cas, Cas3, StpA, HtpG, Lon
nije evidentirano
Podaci o izdanju
106
27.01.2023.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb