Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima (CROSBI ID 730660)

Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa | međunarodna recenzija

Turudić, Ante ; Liber, Zlatko ; Grdiša, Martina ; Jakše, Jernej ; Varga, Filip ; Šatović, Zlatko Detection of divergences in chloroplast genomic data / Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima // Zbornik sažetaka (Međunarodni kongres Oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo) / Dugalić, Ivana ; Haramija, Josip (ur.). 2022. str. 33-34

Podaci o odgovornosti

Turudić, Ante ; Liber, Zlatko ; Grdiša, Martina ; Jakše, Jernej ; Varga, Filip ; Šatović, Zlatko

hrvatski

Identifikacija odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima

Kloroplastni genomi su važan tip podataka u biljnim genomskim istraživanjima jer se često koriste u filogenetskim istraživanjima. Napredak tehnologija sekvenciranja i metoda sastavljanja sekvenci genoma pridonosi povećanju broja javno dostupnih sekvenci kloroplastnog genoma. Broj sastavljenih cjelokupnih kloroplastnih sekvenci je barem za red veličine veći od sastavljenih jezgrenih DNA sekvenci. Stabilna genetska struktura i uniparentalno nasljeđivanje kloroplasta dovodi do niske stope mutacija tijekom evolucije, pa bi tako srodne vrste morale imati vrlo slične kloroplastne sekvence. Ova činjenica te dostupnost velike količine podataka cjelokupnih kloroplastnih genoma omogućila je analizu metoda identifikacije mogućih odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima. Identifikacija odstupanja ukazuje na moguće greške prilikom sastavljanja sekvenci. Analizirali smo odstupanja između sekvenci koje bi trebale biti vrlo slične i provjerili jesu li ta odstupanja uzrokovana različitim metodama sastavljanja sekvenci. Dobiveni rezultati ukazuju na postojanje odstupanja u proučavanim kompletnim kloroplastnim sekvencama te potrebu dodatnih provjera postojećih javno dostupnih podataka.Stoga je moguće unaprijediti i postojeće metode sastavljanja sekvenci uključivanjem sličnih provjera.

javni genetski podaci ; kloroplastni genom ; proces sastavljanja genoma ; provjera podataka

nije evidentirano

engleski

Detection of divergences in chloroplast genomic data

Kloroplastni genomi su važan tip podataka u biljnim genomskim istraživanjima jer se često koriste u filogenetskim istraživanjima. Napredak tehnologija sekvenciranja i metoda sastavljanja sekvenci genoma pridonosi povećanju broja javno dostupnih sekvenci kloroplastnog genoma. Broj sastavljenih cjelokupnih kloroplastnih sekvenci je barem za red veličine veći od sastavljenih jezgrenih DNA sekvenci. Stabilna genetska struktura i uniparentalno nasljeđivanje kloroplasta dovodi do niske stope mutacija tijekom evolucije, pa bi tako srodne vrste morale imati vrlo slične kloroplastne sekvence. Ova činjenica te dostupnost velike količine podataka cjelokupnih kloroplastnih genoma omogućila je analizu metoda identifikacije mogućih odstupanja u kloroplastnim genomskim podacima. Identifikacija odstupanja ukazuje na moguće greške prilikom sastavljanja sekvenci. Analizirali smo odstupanja između sekvenci koje bi trebale biti vrlo slične i provjerili jesu li ta odstupanja uzrokovana različitim metodama sastavljanja sekvenci. Dobiveni rezultati ukazuju na postojanje odstupanja u proučavanim kompletnim kloroplastnim sekvencama te potrebu dodatnih provjera postojećih javno dostupnih podataka.Stoga je moguće unaprijediti i postojeće metode sastavljanja sekvenci uključivanjem sličnih provjera.

public genomic data ; chloroplast genome ; assembling process ; data checking

nije evidentirano

nije evidentirano

nije evidentirano

nije evidentirano

nije evidentirano

nije evidentirano

Podaci o prilogu

33-34.

2022.

objavljeno

Podaci o matičnoj publikaciji

Zbornik sažetaka 15. međunarodnog kongresa oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo

Dugalić, Ivana ; Haramija, Josip

Zagreb: Hrvatsko agronomsko društvo

2459-5721

Podaci o skupu

15. međunarodni kongres Oplemenjivanje bilja, sjemenarstvo i rasadničarstvo

predavanje

08.11.2022-11.11.2022

Zadar, Hrvatska

Povezanost rada

Biologija, Poljoprivreda (agronomija)