hrvatski

PROTEIN BPM1 SUDJELUJE U REGULACIJI METILACIJE DNA DE NOVO I EKSPRESIJE GENA TIJEKOM EMBRIOGENEZE UROČNJAKA (Arabidopsis thaliana)

U biljaka proces embriogeneze, može započeti iz oplođene jajne stanice (zigotna embriogeneza), ali i indukcijom somatskih stanica (somatska embriogeneza). U oba slučaja dolazi do značajnog epigenetičkog reprogramiranja, a jedan od ključnih mehanizama je metilacija DNA posredovana malim molekulama RNA (engl. RNA-directed DNA methylation, RdDM) koja osigurava metilaciju de novo. Uročnjakov protein BPM1 dio je velike porodice proteina MATH-BTB koji sudjeluju u brojnim razvojnim procesima biljaka i životinja kao komponente proteina ubikvitinskih ligaza ovisnih o kulinu. Dodatno, protein BPM1 stupa u interakciju s proteinima DMS3 i RDM1, važnim komponentama u procesu RdDM-a. Interakcije se ostvaruju neovisno o kulinu, upućujući na ulogu proteina BPM1 u regulaciji metilacije DNA de novo. Kromatinskom imunoprecipitacijom identificirane su zajedničke vezne regije proteina BPM1 i DMS3 na genomu uročnjaka te su odabrani geni na kojima su provedene analize ekspresije i metilacije u somatskim i zigotnim embrijima uročnjaka. Također, ispitana je učinkovitost indukcije somatskih embrija u transgeničnim linijama s prekomjernom ekspresijom proteina BPM1 ili DMS3, u liniji s utišanim genima BPM te liniji s nefunkcionalnim proteinom DMS3. Embriogeni potencijal linije s utišanim genima BPM bio je smanjen, dok u linijama s prekomjernom ekspresijom nije došlo do značajnih promjena u odnosu na divlji tip. Dobiveni rezultati upućuju na novu ulogu proteina MATH-BTB u regulaciji metilacije DNA tijekom embriogeneze.

zigotna embriogeneza ; somatska embriogeneza ; metilacija DNA de novo ; BPM1 ; Arabidopsis thaliana

nije evidentirano