hrvatski

Primjena sekvenciranja cijelog egzoma u bolesnika sa sistemskim eritemskim lupusom koji započinje u dječjoj dobi – višestruka studija slučaja

Uvod. Svrha ovog istraživanja bila je ukazati na nove i rijetke genske varijante primjenom sekvenciranja cijelog egzoma (WES) u bolesnika sa sistemskim eritemskim lupusom koji započinje u dječjoj dobi (cSLE) koje bi mogle biti uključene u patogenezu te proširiti postojeće genske baze podataka. Ispitanici i metode. U ovu višestruku studiju slučaja uključeni su bolesnicis cSLE-om pregledani u KBC-u Zagreb u razdoblju od 1991. do 2019. Proveden je WES u skupini 17 trijasa koji su se sastojali od probanda s cSLE-om i oba roditelja, i drugih informativnih članova obitelji, s teškim, atipičnim kliničkim značajkama, sindromskim karakteristikama, ranim početkom bolesti, rezistencijom na konvencionalnu terapiju i/ili obiteljskim obrascem pojavljivanja. Rezultati. U 7 bolesnika s cSLE-om otkriveno je 17 novih i/ili rijetkih varijanti koje mogu pridonijeti nastanku bolesti. Jedna je klasificirana kao patogena, a radi se o strukturnoj varijanti s pomakom okvira čitanja u 34. egzonu gena KMT2D, NM_003482.3:c.8626delC, koja kodira trunkirani protein p.(Gln2876Serfs*34), čime dovodi do gubitka funkcije, u bolesnice sa sindromskom imunodeficijencijom (Kabukijevim sindromom) i teškim oblikom cSLE-a. Identificirane su i tri vjerojatno patogene varijante. Prva u genu za adenozin deaminazu koji djeluje na RNA (ADAR), NM_001111.3:c.2815A>G, koja kodira protein p. (Ile939Val), u bolesnice sa sindromskim obilježjima, promjenama pigmentacije i cSLE-om sa zahvaćanjem većeg broja organskih sustava. Preostale dvije varijante, u genu za B limfocitnu kinazu (BLK), NM_001715.2 ; c.211G>A, koja kodira p. (Ala71Thr), i u genu za receptor komplementa 1 (CR1), NM_000651.4:c.4052dupC, koji kodira p. (Asp1351Glufs*23), detektirane su u bolesnice s teškim cSLE-om i multiorganskim manifestacijama te u njezine majke s istom bolesti. Također smo identificirali niz varijanti klasificiranih kao varijante nesigurna značenja, povezanih s fosforilacijom tirozina, diferencijacijom i proliferacijom stanica, V(D)J rekombinacijom u limfocitima te regulacijom apoptoze i Th1/Th2 polarizacije. Zaključak. Iako je primjena WES-a poboljšala dijagnostiku i liječenje bolesnika s autoimunosnim bolestima, sve je više varijanti koje još uvijek ne možemo koristiti u kliničkom kontekstu. Potrebno je poboljšati metode za njihovu pravilnu kategorizaciju kako bi se povećala količina praktičnih informacija iz WES-a.

sistemski eritemski lupus koji započinje u dječjoj dobi ; monogenski lupus ; sekvenciranje cijelog egzoma ; patogene varijante

nije evidentirano