hrvatski

STRUCTURE AND METHYLATION OF 35S rDNA IN ALLOPOLYPLOIDS Anemone multifida (2n=4x=32, BBDD) AND A. baldensis (2n=6x=48, AABBDD) AND THEIR PARENTAL SPECIES SHOW EVIDENCE OF NUCLEOLAR DOMINANCE

Utišavanje transkripcije 35S rDNA lokusa naslijeđenih od jednog roditelja događa se relativno često u alopoliploidima. Međutim, molekularni mehanizmi uz pomoć kojih je jedan roditeljski subgenom izabran za utišavanje transkripcije još su uvijek nejasni. Upotrebom metoda NGS, bojenja srebrom i bisulfnim sekvenciranjem otkrili smo strukturu, ekspresiju i krajolik metilacije 35S rDNA u dva alopoliploida zajedničkog podrijetla, Anemone multifida (2n = 4x = 32, BBDD) i A. baldensis (2n = 6x = 48, AABBDD), i u njihovim donorima genoma, A. sylvestris (AA), A. cylindrica (BB) i A. parviflora (DD). Veličina osnovne jedinice ponavljanja 35S rDNA varirala je od 10489-12084 pb. Anemone su pokazale organizaciju tipičnu za većinu ribosomskih 35S rDNA. NTS je varijabilniji od ETS. Unutar ETS pronađeno je pet do šest otoka bogatih CpG. Naši rezultati otkrivaju hipometilaciju 35S rDNA porijeklom iz A. parviflora u A. baldensis. Anemone baldensis prolazi ekspanziju kopija 35S rDNA porijeklom iz A. sylvestris i smanjenje broja kopija 35S rDNA porijeklom iz A. parviflora, što je popraćeno nižom razinom metilacije 35S rDNA porijeklom iz A. sylvestris u usporedbi s 35S rDNA porijeklom iz A. parviflora. U A. baldensis nukleolarna dominacija usmjerena je prema subgenomu koji potječe od A. sylvestris pružajući dokaze o ulozi roditelj-specifične 35S rDNA metilacije u nukleolarnoj dominaciji.

bisulfitno sekvenciranje, CpG otoci, IGS, Ranunculaceae, poliploidija

nije evidentirano