Nalazite se na CroRIS probnoj okolini. Ovdje evidentirani podaci neće biti pohranjeni u Informacijskom sustavu znanosti RH. Ako je ovo greška, CroRIS produkcijskoj okolini moguće je pristupi putem poveznice www.croris.hr
izvor podataka: crosbi !

Strojno učenje za predviđanje optimalnog razrjeđenja likvora za određivanje indeksa specifičnih antitijela (CROSBI ID 725566)

Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa | domaća recenzija

Turčić, Ana ; Vogrinc, Željka ; Zaninović Ljiljana Strojno učenje za predviđanje optimalnog razrjeđenja likvora za određivanje indeksa specifičnih antitijela // Biochemia Medica 32/(Suppl 1). Zagreb: Biochemia Medica, 2022. str. S209-S210

Podaci o odgovornosti

Turčić, Ana ; Vogrinc, Željka ; Zaninović Ljiljana

hrvatski

Strojno učenje za predviđanje optimalnog razrjeđenja likvora za određivanje indeksa specifičnih antitijela

Uvod: Nadzirano strojno učenje otkriva prediktivni algoritam koji se temelji na skupu podataka poznatih ulaznih i izlaznih varijabli. Cilj je stvoriti algoritam za predviđanje optimalnog razrjeđenja likvora za određivanje indeksa specifičnih antitijela radi smanjenja ponavljanih mjerenja. Materijali i metode: Model stabla odlučivanja, metoda nadziranog strojnog učenja, korištena je u skupini od 464 pacijenta s 5 varijabli ulaznih podataka: kvocijent albumina, koncentracija imunoglobulina G (IgG) u likvoru, kvocijent IgG-a, postotak intratekalne sinteze (ITS) i vrijednost limesa. Koncentracije albumina i IgG-a u likvoru i serumu određene su imunonefelometrijski na Atellica NEPH 630 analizatoru (Siemens Healthineers, Erlangen, Njemačka), a ITS i limes dobiveni su izračunom prema Reiberu. Koncentracije IgG antitijela na morbile, rubellu, varicella-zoster virus i herpes simplex virus 1 i 2 određene su u likvoru i serumu ELISA metodom (Euroimmun, Lübeck, Njemačka). Definirano je optimalno razrjeđenje likvora za pojedini virus te je dobiven mod koji je korišten kao klasifikacijska varijabla za potrebno razrjeđenje. Podaci su podijeljeni u set podataka za trening (N = 348) i testiranje (N = 116). Za kreiranje stabla odlučivanja na podacima za trening korišten je rpart paket, a funkcija rpart.plot za vizualizaciju stabla odlučivanja u programu R (RStudio, Boston, SAD). Točnost predviđanja izračunata je na setu testnih podataka. Rezultati: Algoritam stabla odlučivanja uključio je varijable IgG i ITS. Predviđeno razrjeđenje likvora je 2x ako je koncentracija IgG-a<56 mg/L, a 4x ako je koncentracija IgG-a > 103 mg/L. Za ostale koncentracije IgG-a predviđeno razrjeđenje je 3x ako je ITS > 43%. U suprotnom, ako je koncentracija IgG-a < 72 mg/L, predviđeno razrjeđenje je 2x, a 3x ako je koncentracija IgG-a > 72 mg/L. Algoritam ne predviđa viša razrjeđenja zbog malog broja podataka u setu. Točnost modela je 86, 2%, dok bez predviđanja razrjeđenja 74, 3% pacijenata nije trebalo ponavljano mjerenje. Zaključak: Dobiven je algoritam visoke točnosti za predviđanje optimalnog razrjeđenja likvora što smanjuje broj ponavljanja.

strojno učenje, MRZ reakcija

nije evidentirano

engleski

Machine learning for predicting optimal cerebrospinal fluid dilution for analysis of specific antibody indices

nije evidentirano

machine learning, MRZ reaction

nije evidentirano

Podaci o prilogu

S209-S210.

2022.

objavljeno

Podaci o matičnoj publikaciji

Biochemia Medica 32/(Suppl 1)

Zagreb: Biochemia Medica

1849-8205

Podaci o skupu

10. kongres Hrvatskog društva za medicinsku biokemiju i laboratorijsku medicinu = 10th Congress of the Croatian Society of Medical Biochemistry and Laboratory Medicine

poster

28.09.2022-01.10.2022

Zagreb, Hrvatska

Povezanost rada

Biotehnologija u biomedicini (prirodno područje, biomedicina i zdravstvo, biotehničko područje), Kliničke medicinske znanosti