hrvatski

Cijanobakterijska raznolikost oklopa Jadranskih glavatih želvi

DNA metabarkodiranje se sve više koristi u opisivanju sastava mikrobnih zajednica u različitim staništima. Ova metoda je posebno obećavajuća za cijanobakterije budući da je tradicionalna morfološka identifikacija otežana fenotipskim varijacijama vrsta, nedostatkom obučenih taksonoma i podcjenjivanjem raznolikosti vrsta. Brzina i neinvazivnost metode koja koristi sekvenciranje amplikona pokazali su se pogodnim za istraživanje mikrobioma ugroženih divljih životinja kao što su morske kornjače. Cijanobakterije su prepoznate kao važan dio mikrobne zajednice biofilma oklopa glavatih želvi (Carreta caretta) te je nađeno da pridonose i do 20% cjelokupnoj zajednici u biofilmu. Cilj ovog istraživanja je pružiti detaljan uvid u sastav, raznolikost i ekologiju cijanobakterija koje nastanjuju oklop morskih kornjača koristeći pristup sekvenciranja amplikona. Uzorci biofilma oklopa prikupljeni su 2020. i 2021. godine od 28 glavatih želvi koje nastanjuju istočno Jadransko more. Izolirana je ukupna DNA te su 16S rDNA amplikoni sekvencirani pomoću Illumina MiSeq platforme. Korištena su dva seta specifičnih primera: set primera 341F/805R za V3-V4 regiju 16S rDNA i primeri 1328F/ 664R za 16S rDNA V6 regiju. Dobiveni podaci biti će bioinformatički analizirani, a rezultati ove studije poslužit će kao jedan od prvih koraka u razumijevanju odnosa između cijanobakterija i njihovih domaćina morskih kornjača, vrijednih i ugroženih morskih gmazova.

cijanobakterije ; metabarkodiranje ; 16S ; mikrobiota ; Carreta caretta

nije evidentirano