Genomski signali pozitivne selekcije identificirani kod Pastirskih pasa (CROSBI ID 724724)
Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa | domaća recenzija
Podaci o odgovornosti
Shihabi, Mario ; Glavaš, Vjeran ; Cubric-Curik, Vlatka ; Zorc, Minja ; Dovc, Peter ; Curik, Ino
hrvatski
Genomski signali pozitivne selekcije identificirani kod Pastirskih pasa
Pastirski psi (Canis familiaris) veliki su psi prilagođeni surovim planinskim okruženjima te specijalizirani za zaštitu stoke na ispaši od velikih grabežljivaca u sustavima slobodne ispaše. U isto vrijeme, dugoročni proces umjetne selekcije oblikovao je njihovo ponašanje prema inteligenciji, pouzdanosti, pažljivosti i zaštitništvu. Stoga, kako bismo poboljšali naše razumijevanje mehanizama prilagodbe okolišu i odgovora na umjetnu selekciju kod pastirskih pasa, signali pozitivne selekcije identificirani su u meta-populaciji koju predstavlja devet pastirskih pasmina (116 jedinki) na temelju informacija iz 104 618 SNP genotipova. Primijenjena su dva klasična unutar populacijska pristupa, od kojih ekstremno frekventni homozigotni nizovi (eROHi) mogu detektirati gotovo i potpuno fiksirane selektivne mahove, dok je integrirana ocjena haplotipa (iHS) pouzdanija u otkrivanju slabijih mahova. Identificirano je 28 genomskih regija (11 korištenjem eROHi pristupa i 17 korištenjem iHS pristupa) koje pokazuju visoko značajne signale pozitivne selekcije. Neki od najizraženijih selekcijskih signala povezani su s genima kao što su LRIG3, TRIP11, CNTNAP2 i EFNA5. Predstavljeni rezultati pridonijet će razumijevanju sinergijske bihevioralne interakcije pastirskih pasa s ljudima i pašnim životinjama, posebice ovcama i kozama, te prilagodbi sisavaca na surove planinske uvjete, kao i upravljanju njihovim uzgojem.
pastirski psi, prilagodba okolišu, sinergijska bihevioralna interakcija. signali selekcije
nije evidentirano
engleski
Genome-wide signals of positive selection identified in Livestock Guardian Dogs
nije evidentirano
Livestock Guardian Dogs, environmental adaptation, synergistic behavioural interaction, selection signals
nije evidentirano
Podaci o prilogu
10-11.
2022.
objavljeno
Podaci o matičnoj publikaciji
Podaci o skupu
Dani doktorata biotehničkog područja
predavanje
28.09.2022-29.09.2022
Zagreb, Hrvatska
Povezanost rada
Biologija, Interdisciplinarne biotehničke znanosti, Poljoprivreda (agronomija)