hrvatski

Analiza PI3P-vežućih proteina s FYVE domenom u transkriptomu i proteomu trombocita

Stanje uravnoteženog proteoma – proteostaza, ključno je za sve fiziološke procese u organizmu, te je razina pojedinih proteina određena brzinom njihove sinteze, kao i razgradnje te dostupnosti i razine transkripata. Jedna od važnih obitelji fosfolipida u staničnim membranama koji stupaju u interakciju s proteinima je obitelj fosfoinozitida. Svaki odjeljak membrane sadrži neke od karakterističnih fosfoinozitida (ukupno 7 različitih): fosfatidilinozitol-3-monofosfat (PI3P), fosfatidilinozitol-4-monofosfat (PI4P), fosfatidilinozitol-5-monofosfat (PI5P), fosfatidilinozitol-3, 4-difosfat [PI(3, 4)P2], fosfatidilinozitol-3, 5-difosfat [PI(3, 5)P2], fosfatidilinozitol-4, 5-difosfat [PI(4, 5)P2] i fosfatidilinozitol-3, 4, 5-trifosfat [PI(3, 4, 5)P3]. PI3P čini otprilike 15% ukupnih fosfoinozitida u ljudskim stanicama, shodno tome, ovdje se daje detaljna analiza funkcije PI3P, specifične FYVE domene koju veže te proteine koji sadrže FYVE domenu. Osim FYVE domene, PI3P veže i Phox te plekstrin homolognu domenu. U ovom radu analizirani su dostupni podaci transkriptoma i proteoma ljudskih i mišjih trombocita na prisustvo proteina s FYVE domenom te je napravljena usporedba između trombocita ovih dviju vrsta. Korištenjem dostupnih baza DepMap i Međunarodnog konzorcija za fenotipizaciju miševa analizirana je uspješnost stvaranja staničnih linija s delecijom za proteine s FYVE domenom koji su visoko eksprimirani u ljudskom i mišjem proteomu kao i posljedice nedostatka odabranih gena u miševa na njihovu letalnost, i/ili hematološki fenotip. Nadalje, dan je pregled mehanizma kojim PI3P regulira nastanak i funkciju trombocita, ali i općenito kako disfunkcija stvaranja PI3P utječe na različite procese u stanici ili u organizmu.

PI3P-vežući proteini s FYVE domenom, transkriptom, proteom, trombociti, megakariociti

nije evidentirano