hrvatski

Filogenetska analiza izolata poliomavirusa iz nekoliko uzgoja papiga u Republici Hrvatskoj

Ptičji poliomavirus jedan je od najznačajnijih virusnih patogena kaveznih ptica te svake godine rezultira znatnim ekonomskim gubicima za uzgajivače i vlasnike trgovina za kućne ljubimce. Najrazornije epidemije bolesti događaju se u velikim komercijalnim uzgojima tigrica gdje se ptice uzgajaju u volijerama s desecima ili stotinama ptica slobodno držanih ptica. I mladi i odrasli primjerci tigrica osjetljivi su na zarazu. Stopa smrtnosti mladunaca često je visoka i može se približiti 100% kada se virus prvi put unese u volijeru. Uzročnik je DNK virus iz porodice Polyomaviridae, roda Polyomavirus. Cilj ovog istraživanja bio je filogenetskom analizom sekvenci specifično umnoženih odsječaka genoma utvrditi njihovu međusobnu srodnost kao i srodnost sa sojevima iz međunarodnih baza genoma poput NCBI baze. U istraživanju su korišteni uzorci iz arhive Zavoda za bolesti peradi s klinikom, prethodno izdvojeni iz uginulih ptica kućnih ljubimaca. Iz unutarnjih organa izdvojena je ukupna DNK, umnožena PCR metodom korištenjem specifičnih početnica, nakon čega su umnoženi isječci sekvencirani Sanger metodom u svrhu provedbe filogenetske analize. Filogenetska analiza je pokazala određeni stupanj heterogenosti s obzirom na porijeklo, ali ne i s obzirom na vrstu ptice i sam uzgoj. Utvrđen je slučaj pojave varijacija dvaju izolata ptičjeg poliomavirusa u istom domaćinu, u njegova dva organa, jetri i slezeni, koji se djelomično razlikuju, što nije opisano u dosadašnjoj literaturi.

papige ; Polyomavirus ; PCR ; sekvenciranje ; filogenetska analiza

nije evidentirano