hrvatski

Selekcija i molekularna identifikacija bakterijskih izolata s kutikule slatkovodnih rakova koji inhibiraju rast micelija patogena Aphanomyces astaci Schikora, 1906

Slatkovodni deseteronožni rakovi, ključne vrste slatkovodnih staništa, ugroženi su širenjem invazivnih stranih vrsta rakova i bolesti račje kuge, koju uzrokuje patogeni mikroorganizam Aphanomyces astaci Schikora, 1906. Osim što patogen ugrožava prirodne populacije zavičajnih vrsta slatkovodnih rakova, uzrokuje i velike štete u akvakulturi. Kemijski tretmani koji se trenutno koriste za kontrolu ovog patogena štetni su za rakove, ljude i ekosustav pa je potrebno razviti učinkovite i ekološki prihvatljive metode kontrole, poput biokontrole. Stoga je cilj ovoga istraživanja testiranje inhibicijskog potencijala bakterijskih izolata prisutnih na kutikuli dvije vrste rakova: uskoškarog raka - Pontastacus leptodactylus (Eschscholtz, 1823) (zavičajna vrsta) i signalnog raka - Pacifastacus leniusculus (Dana, 1852) (invazivna strana vrsta). Bakterijski izolati su identificirani masenom spektrometrijom MALDI-TOF i sekvenciranjem gena 16S rRNA. Većina sakupljenih izolata pripada koljenu Proteobacteria (69 %), zatim Bacteroidetes (17 %) i Firmicutes (8 %). Nadalje, testirana je sposobnost svakog izolata da uspori ili zaustavi rast micelija A. astaci koristeći in vitro testove inhibicije te su izolati razvrstani u dvije skupine: inhibitori (33 %) i ne-inhibitori (67 %). Više od polovice izolata inhibitora (56 %) pripadalo je rodu Pseudomonas. Ovo istraživanje je prvi korak u identifikaciji bakterijskih izolata koji bi mogli biti upotrijebljeni za biokontrolu patogena A. astaci

biokontrola, račja kuga, epibionti, test inhibicije

nije evidentirano