hrvatski

Računalne simulacije proteina SloR iz bakterije Streptococcus mutans

Streptococcus mutans, primarni uzročnik dentalnog karijesa kod ljudi, je patogena bakterija koja raste na površini zuba i sastavni je dio dentalnog plaka. Homeostaza iona metala od esencijalne je važnosti za rast i preživljavanje većine mikroorganizama, uključujući bakteriju S. mutans [1]. Dvovalentni ioni metala, kao što su Fe2+ i Mn2+, nužni su kofaktori easencijalnih enzima te često aktiviraju i stabiliziraju strukture proteina u raznim metaboličkim putevima. Homeostaza iona Fe2+ i Mn2+ u bakteriji S. mutans regulirana je od strane proteina SloR. SloR je transkripcijski faktor kojem afinitet vezanja za molekulu DNA ovisi o koncentraciji iona mangana [2]. U fiziološkim uvjetima, protein SloR se nalazi u obliku homodimera kod kojeg svaka podjedinica veže tri iona mangana [3]. Provedene su simulacije molekulske dinamike kojima se nastoje istražiti strukturna i dinamička svojstva različitih oblika proteina SloR uz korištenje različitih parametara za opis interakcija manganovih iona i aminokiselina.

poster, simulacije molekularne dinamike, S. mutans, SloR

nije evidentirano