Raspodijeljeno de novo sastavljanje genoma na platformi Apache Spark (CROSBI ID 448271)
Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad
Podaci o odgovornosti
Džaja, Mirko
Pripužić, Krešimir
hrvatski
Raspodijeljeno de novo sastavljanje genoma na platformi Apache Spark
U ovom radu je predstavljeno sastavljanje genoma na raspodijeljenim sustavima. Konkretno, detaljno je opisana platforma Apache Spark koja omogućuje raspodijeljeno izvođenje. Predstavljeno je sastavljanje genoma, dvije tehnike od kojih smo se odlučili za de novo da je pobliže opišemo. Uspoređujući dva de novo algoritma, SORA i SpaRC, došli smo do zaključka da postoji široki spektar različitih algoritama koji imaju različite stupnjeve raspodijeljenosti. Zahvaljujući tome svatko može izabrati koji će algoritam koristiti u svojim istraživanjima, a to prvenstveno ovisi o dostupnim računalnim resursima.
de novo ; genom ; Apache Spark ; grozd ; SORA ; SpaRC
nije evidentirano
engleski
Distributed De Novo Genome Assembly on Apache Spark
nije evidentirano
de novo ; genome ; Apache Spark ; cluster ; SORA ; SpaRC
nije evidentirano
Podaci o izdanju
30
09.07.2021.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Fakultet elektrotehnike i računarstva
Zagreb