Transkripcijske značajke pleomorfnih varijanti bakterije Borrelia burgdorferi (CROSBI ID 715522)
Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa
Podaci o odgovornosti
Čorak, Nina ; Daschkin, Christina ; Krey, Viktoria ; Koska, Sara ; Futo, Momir ; Široki, Tin ; Anniko, Sirli ; Woichansky, Innokenty ; Opašić, Luka ; Kifer, Domagoj ; Vlahoviček, Kristian ; Maxeiner, Horst-Günter ; Domazet-Lošo, Mirjana ; Nicolaus, Carsten ; Domazet-Lošo, Tomislav
hrvatski
Transkripcijske značajke pleomorfnih varijanti bakterije Borrelia burgdorferi
Bakterija Borrelia burgdorferi vektorski se prenosi putem krpelja i primarni je uzročnik Lajamske bolesti. U laboratorijskim uvjetima stanice B. burgdorferi mogu postojati u nekoliko različitih pleomorfnih oblika (morfotipova). Dok su funkcionalne i strukturne razlike među nekim morfotipovima već prethodno opisane, ekspresijske razlike na razini transkriptoma do sada nisu istražene. S tim ciljem uzgojili smo laboratorijske kulture različitih morfotipova (spiralni, okrugli, bleb i biofilm), izolirali ukupnu RNA, sekvencirali je te skupili podatke o razlici u ekspresiji na razini transkriptoma. Otkrili smo da unatoč morfološkim razlikama, spiralni i okrugli morfotipovi imaju sličan ekspresijski profil, dok bleb i biofilm morfotipovi pokazuju značajnu razliku u ekspresiji kako međusobno tako i u odnosu na spiralni i okrugli morfotip. Unatoč tome što okrugli morfotip ima transkripciju sličnu spiralnom morfotipu, u okruglom morfotipu su pojačano su eksprimirani geni uključeni u procese transkripcije i translacije. Iako bleb i biofilm morfotipovi imaju veći broj pojačano eksprimiranih gena o odnosu na okrugli oblik, funkcija tih gena je pretežito nepoznata. Geni koji su pojačano eksprimirani u okruglom morfotipu su pretežito locirani na bakterijskom kromosomu, dok se pojačano eksprimirani geni bleb i biofilm morfotipova uglavnom nalaze na plazmidima. Kako bi definirali evolucijsko podrijetlo diferencijalno eksprimiranih gena bakterije B. burgdorferi koristili smo genomsku filostratigrafiju. Otkrili smo da su geni koji su pojačano eksprimirani u okruglom morfotipu obogaćeni evolucijski starim genima karakterističnim za sve stanične organizme, dok su geni pojačano eksprimirani u bleb i biofilm morfotipovima evolucijski mlađi i specifični za porodicu Borreliaceae. Naši rezultati upućuju na to da je tranzicija iz spiralnog u okrugli morfotip regulirana malim brojem evolucijski visoko konzerviranih gena koji sudjeluju u transkripciji i translaciji, dok je prijelaz iz spiralnog morfotipa u bleb ili biofilm morfotip popraćen velikim ekspresijskim promjenama koje uključuju pojačanu ekspresiju evolucijski mlađih gena nepoznate funkcije.
transkriptom, pleomorfne varijante, Borrelia burgdorferi
nije evidentirano
engleski
Transcriptome profiling of Borrelia burgdorferi pleomorphic variants
nije evidentirano
transcriptome, pleomorphic variants, Borrelia burgdorferi
nije evidentirano
Podaci o prilogu
87-88.
2021.
objavljeno
Podaci o matičnoj publikaciji
Podaci o skupu
5. Simpozij Studenata Doktorskih Studija PMF-a
predavanje
24.04.2021-25.04.2021
Zagreb, Hrvatska