Računalne simulacije transkripcijskog faktora MntR iz bakterije Bacillus subtilis (CROSBI ID 714914)
Prilog sa skupa u zborniku | sažetak izlaganja sa skupa | domaća recenzija
Podaci o odgovornosti
Jelić Matošević, Zoe ; Loubser, Jolene ; Cukrowski, Ignacy ; Bertoša, Branimir
hrvatski
Računalne simulacije transkripcijskog faktora MntR iz bakterije Bacillus subtilis
Homeostaza iona prijelaznih metala od esencijalne je važnosti za mikroorganizme. Naime, ioni prijelaznih metala nužni su za normalno funkcioniranje stanice, ali visoke koncentracije istih mogu biti toksične. Stoga su razvijeni osjetljivi mehanizmi kontrole i regulacije stanične koncentracije iona prijelaznih metala. Kod bakterija se homeostaza metala najčešće regulira metalosenzorima – transkripcijskim faktorima čiji afinitet za vezanje DNA ovisi o vezanju metalnih iona [1]. Bakterija Bacillus subtilis živi u tlu i kao crijevni komenzal te je modelni organizam za gram-pozitivne bakterije. U B. subtilis homeostaza mangana regulirana je transkripcijskim faktorom MntR, čiji se afinitet za DNA povećava uslijed vezanja manganovih iona [2]. MntR se u otopini nalazi kao dimer, a svaka podjedinica veže dva iona mangana u binuklearnom veznom mjestu [3, 4]. Simulacijama molekulske dinamike istraženi su alosterički efekti koje izaziva vezanje Mn2+ iona u vezna mjesta MntR proteina.
molekulska dinamika, transkripcijski faktori, MntR
nije evidentirano
engleski
Computational simulations of the transcriptional regulator MntR from the bacteriujm Bacillus subtilis
nije evidentirano
electrostatics ; polarization ; interaction energy ; Hansen–Coppens model ; protein–ligand interactions ; Charger
nije evidentirano
Podaci o prilogu
330-331.
2021.
objavljeno
Podaci o matičnoj publikaciji
Barišić, Dajana
Zagreb:
978-953-6076-90-1
Podaci o skupu
5. Simpozij studenata doktorskih studija PMF-a = 5th Faculty of Science PhD Student Symposium
poster
24.04.2021-25.04.2021
Zagreb, Hrvatska
