hrvatski

Istraživanje interakcija klaritromicina i ribosoma izoliranog iz bakterije Escherichia coli spektroskopijom NMR

Klaritromicin je predstavnik druge generacije makrolidnih antibiotika, u koju spada i poznatiji azitromicin. Makrolidni antibiotici (makrolidi) se koriste u liječenju infekcija uzrokovanih Gram pozitivnim i Gram-negativnim bakterijama. Vezanjem za veliku podjedinicu bakterijskog ribosoma makrolidi inhibiraju translaciju proteina čime ubijaju bakterijske stanice. Učestalom primjenom makrolida bakterije su razvile različite mehanizme otpornosti na njihovo djelovanje. Stoga je interes znanosti preusmjeren na razvoj novih makrolidnih antibiotika. Za uspješan dizajn novog makrolida važno je razumjeti njegove interakcije s bakterijskim ribosomom. Stoga je cilj ovog rada okarakterizirati strukturu i interakcije klaritromcina s ribosomom izoliranim iz bakterije Escherichia coli u otopini primjenom jedno- i dvodimenzijskih tehnika NMR. Tehnikama NOESY (engl. nuclear Overhauser effect spectroscopy) i ROESY (engl. rotating frame Overhauser effect spectroscopy) određena je konformacija klaritromicina u slobodnom stanju, a pomoću prijenosnog NOESY određena je konformacija vezanog klaritromicina. Nadalje, metodom STD (engl. saturation transfer difference) proučene su interakcije klaritromicina s ribosomom iz E. coli i određeni su vezni epitopi.

interakcije ; klaritromicin ; makrolidi ; ribosom ; spektroskopija NMR

nije evidentirano