hrvatski

Rotavirusi kod domaćih svinja: visoka prevalencija, genetska raznolikost i značaj međuvrsnog prijenosa

Rotavirusi, a poglavito rotavirus A (RVA) su široko rasprostranjeni enterični patogeni koji su ujedno i najznačajniji uzročnici gastroenteritisa kod djece. Smatra se da uzrokuju oko 130.000 smrtnih slučajeva u zemljama u razvoju, ali i značajan broj hospitalizacija u razvijenim zemljama s visokim higijenskim standardima. Vrlo su važan uzročnik proljeva u mlađih dobnih kategorija domaćih svinja, te se smatra da su enzootski prisutni u uzgojima. Uzročnik je dsRNA virus segmentiranog genoma, pripadnik roda Rotavirus, porodice Reoviridae te je do danas prepoznato devet vrsta, od kojih je RVA daleko najučestalija, a time i najznačajnija vrsta. Rotavirusna dsRNA je obavijena troslojnom kapsidom čiji površinski sloj čine virusni proteini VP7 i VP4 koji su osnova binarne klasifikacije, određivanjem genotipa G i P. Do danas je kod RVA prepoznato minimalno 36 različitih genotipa G i 51 genotip P. Segmentirani genom je osnovni razlog pojave genetskog preslagivanja koje uvjetuje iznimno veliku genetsku heterogenost rotavirusa te učestalu pojavu potencijalno emergentnih humano- animalnih presloženica što predstavlja osnovu zoonotskog potencijala rotavirusa. Cilj ovog istraživanja je bio utvrditi prevalenciju i genetsku raznolikost rotavirusa A u velikim farmskim i malim dvorišnim uzgojima domaćih svinja u Republici Hrvatskoj te pri tome utvrditi značaj međuvrsnog prijenosa. U razdoblju od 2018-2020. godine uzorkovano je ukupno 363 uzoraka rektalnih briseva pretežno mlađih dobnih kategorija domaćih svinja podrijetlom iz sedam farmskih i 21 dvorišnog uzgoja s područja osam županija (Osječko-baranjska, Vukovarsko-srijemska, Požeško- slavonska, Sisačko-moslavačka, Zagrebačka, Međimurska, Varaždinska i Splitsko-dalmatinska županija). Rotavirus A je dokazivan primjenom metode RT-PCR u stvarnom vremenu za umnožavanje dijela VP2 genomskog segmenta. Svi pozitivni uzorci su genotipizirani primjenom različitih metoda konvencionalnog RT-PCR-a za umnožavanje VP7 i VP4 genomskog segmenta. Sekvenciranjem odabranih pozitivnih uzoraka utvrđen je genotip G i P te najčešće genotipske kombinacije. Dobivene sekvence su potom korištene u postupku filogentske analize upotrebom programskog paketa MEGA X. Rezultati ukazuju na iznimno visoku prevalenciju RVA od 44% u uzgojima domaćih svinja u Republici Hrvatskoj, a barem jedan pozitivan uzorak je potvrđen u svakom uzgoju. Također je RVA utvrđen i na području svih županija. Rotavirusi koji cirkuliraju u području Republike Hrvatske su iznimno genetski raznoliki sa sedam različitih genotipova G (G2, G3, G4, G5, G6, G9, G11) i četiri različita genotipa P (P[6], P[13], P[23] i P[32]) uz čak 11 različitih genotipskih kombinacija. Važno je istaknuti pojavnost iznimno rijetkog genotipa P[32]. Kada govorimo o međuvrsnom prijenosu RVA, on je utvrđen primarno između rotavirusa domaćih i divljih svinja. Temeljem naših dosadašnjih istraživanja, možemo reći da osim s divljim svinjama, rotavirusi koji cirkuliraju u domaćih svinja izmjenjuju svoj genetski materijal i s rotavirusima kod ljudi, goveda, pasa i lisica. Zaključno je važno istaknuti visoku zastupljenost RVA u uzgojima domaćih svinja u Republici Hrvatskoj što ide u prilog činjenici da se radi o enzootskom virusu. Obilježja genoma RVA uvjetuju visoku genetsku raznolikost kod domaćih svinja, a posljedično i međuvrsni prijenos koji ponajprije karakterizira razmjena segmenata genoma. Iako se javlja sporadično, evidentno je preslagivanje genomskih segmenata između humanih i rotavirusa domaćih svinja te pojava novih potencijalno emergentnih humano-svinjskih presloženica. Stoga je važno sustavno pratiti molekularnu epidemiologiju sojeva RVA u ekosustavu uz primjenu koncepta Jednog zdravlja.

Rotavirus A ; domaća svinja ; genomsko preslagivanje ; međuvrsni prijenos ; zoonoza ; jedno zdravlje

nije evidentirano