hrvatski

Struktura genoma najznačajnijih vrsta riba u mediteranskoj akvakulturi

U ovom završnom radu predstavljene su biološke i ekološke karakteristike dviju najznačajnijih vrsta u mediteranskoj akvakulturi za koje je dostupan kvalitetan nacrt genoma, komarče Sparus aurata (Linnaeus, 1758) i lubina Dicentrarchus labrax (Linnaeus, 1758). Komarča je protandrični dvospolac što je čini zanimljivim modelom za istraživanje hermafroditizma i razvoja spolno- pristranih (SB) gena čija diferencijalna ekspresija dovodi do razvoja spolnog dimorfizma. Genom komarče se sastoji od >760 Mbp i 24 kromosoma u haploidnom setu. Uočeno je da se SB geni komarče ponašaju drugačije nego kod gonohorističnih vrsta. Jedino vrlo konzervirani ženski SB geni sa snažnom razlikom u ekspresiji brže evoluiraju od ostalih gena. Navedena činjenica se potencijalno dovodi u vezu sa smanjenom efektivnom veličinom populacije ženki i smanjenom purificirajućom selekcijom. Kod lubina je posebno zanimljiva njegova eurihalinost te je u genomu identificirano nekoliko genskih obitelji s ulogom u osmoregulaciji i membrasnkom transportu (klaudini, akvaporini, prolaktini). Genom lubina je veličinom nešto manji od genoma komarče i također ima 24 kromosoma. Analizom nukleotidne raznolikosti na razini čitavog genoma su uočeni zanimljivi heterogeni obrasci diferencijacije i smanjene rekombinacije za koje se smatra da su rezultat erozije divergencije i nejednolike introgresije uslijed sekundarnog kontakta nakon dugog perioda alopatrijske izolacije.

Sparus aurata, Dicentrarchus labrax, dvospolnost, halotolerancija, genom, diferencijacija

nije evidentirano