Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca (CROSBI ID 444149)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Shihabi, Mario
Čurik, Ino
hrvatski
Identifikacija signala pozitivne selekcije u genomu hrvatskih ovaca
Ovčarstvo je jedan od najvažnijih stočarskih sektora u mediteranskom području Hrvatske odakle potječe većina hrvatskih autohtonih pasmina. Prisutni signali pozitivne selekcije posljedica su adaptacije na oskudne okolišne čimbenike, ali i odabira (selekcije) ljudi. U ovom istraživanju je uz autosome bio uključen i spolni kromosom X (kod ženskih jedinki), zbog utjecaja spolno vezanog nasljeđivanja na ekonomski i evolucijski važna svojstva. Cilj rada bio je identificirati signale pozitivne selekcije putem dvije metode, iHS i eROHi, koristeći uzorak veličine 102 jedinke iz 4 autohtone pasmine ovaca Hrvatske i 606 006 SNP-ova (Infinium® HD SNP BeadChip), na kojem je prije analize obavljena kontrola kvalitete. Obje metode temelje se na analizi genomskih varijacija unutar jedne velike metapopulacije, koja ovdje predstavlja hrvatske autohtone pasmine ovaca. Uočeni su mnogi ekonomski i evolucijski važni geni te je tako razjašnjena prisutnost pojedinih signala u populaciji. Za precizniju i pouzdaniju analizu potrebno je povećati uzorak te uključiti još metoda identifikacije.
Hrvatske autohtone pasmine ovaca ; Signali pozitivne selekcije ; Kandidat geni ; Autosomi ; Spolni kromosom X
nije evidentirano
engleski
Identification of positive selection signatures in the genome of Croatian sheep
nije evidentirano
Croatian autochthonous sheep breeds ; Positive selection signatures ; Candidate genes ; Autosomes ; Sex chromosome X
nije evidentirano
Podaci o izdanju
48
12.07.2021.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Agronomski fakultet
Zagreb