hrvatski

Geografska raspodjela genetske varijabilnosti populacije svinja banijske šare

Cilj istraživanja je utvrditi čini li populacija svinje banijske šare zasebnu genetsku strukturu razlučivu od geografski i genetski bliskih populacija, pomoću multivarijatnih metoda i prostorne informacije. Prostornom analizom glavnih komponenti (sPCA), te geneland klasteriranjem obrađeni su georeferencirani mikrosatelitni genotipovi 86 jedinki četiri pasmine svinja (turopoljske, crne slavonske, banijske šare i njemačkog landrasa) u sustavu R pomoću adegenet i geneland paketa. Rezultati sPCA pokazuju: (i) da se očekivani utjecaj genotipa turopoljske svinje na banijsku šaru progresivno smanjuje u jugoistočnom smjeru ; (ii) uzorci turopoljske svinje razdvajaju se od ostalih prvom globalnom osi ; (iii) uzorci banijske šare grupiraju se u dvije skupine. Geneland analizom potvrđeni su rezultati sPCA i prepoznato je pet klastera te su izrađene karte. Banijska šara je razlučiva od ostalih analiziranih pasmina, te uzorci čine dvije genetske skupine.

multivarijatne metode ; sPCA ; paket geneland ; autohtone pasmine svinja ; paket adegenet

https://repozitorij.agr.unizg.hr/islandora/object/ag r:1513