hrvatski

Multigenska tipizacija izolata bakterija Burkholderia cepacia kompleksa Martina Drmić

Burkholderia cepacia kompleks skupina je Gram- negativnih nefermentirajućih bakterija koju čine 24 usko povezane vrste poznate kao autohtone bakterije u prirodnom okolišu, ali i kao uzročnici infekcija u imunokompromitiranih bolesnika. Budući da u Hrvatskoj do sada nema podataka o vrstama ovog kompleksa, cilj ovog diplomskog rada jest metodom molekularne identifikacije i multigenske tipizacije okarakterizirati sedam prethodno prikupljenih okolišnih izolata te jedan klinički izolat bakterija Burkholderia cepacia kompleksa kako bih ukazala na važnost poznavanja ovih vrsta koje se u okolišu brzo šire pod utjecajem odlaganja ljudskog i životinjskog otpada. Analizom sam obuhvatila gene za 16S rRNA, lepA, atpD, gyrB, gltB, phaC, recA i trpB. Prethodnu identifikaciju izolata kao potencijalnih Burkholderia sp. potvrdila sam molekularnom identifikacijom i filogenetskom analizom gena za 16S rRNA, a multigenskom tipizacijom odredila sam profile genotipova svih izolata. Rezultati analize pokazali su da se radi o vrstama B. multivorans, B. cenocepacia i B. ambifaria, a zabilježena je i pojava novih alela (genotipova) i profila ST (sequence type) ovih vrsta. Vrste Burkholderia cepacia kompleksa često su rezistentne na mnoge antibiotike stoga sam dokazala i mogući mehanizam rezistencije ovih izolata analizom fragmenta gena blaTEM koji kodiraju ß- laktamaze. Rana identifikacija vrsta ovog kompleksa iznimno je važna u sprječavanju prijenosa infekcija ovim bakterijama i ispravnog odabira antibiotika u njihovom liječenju.

Burkholderia cepacia kompleks, identifikacija, genotipizacija, 16S rRNA, blaTEM, filogenetska analiza

nije evidentirano