hrvatski

Uloga proteomike u utvrđivanju proteina uključenih u patofiziologiju oboljenja jetre

Kronična bolest jetre predstavlja veliki i rastući zdravstveni i ekonomski teret u društvu. Bolesti jetre su općenito asimptomatske sve dok ne dođe do očitih komplikacija i do ozbiljnog oštećenja jetre. S obzirom na progresivni i općenito neotkriveni tijek bolesti jetre, od velike važnosti je primjena modernih „omics“ tehnologija u identifikaciji specifičnih proteina koji bi mogli imati uzročnu ulogu u bolesti. Povezivanjem genetskih čimbenika s bolestima putem specifičnih proteina, omogućava se isticanje potencijalnih terapijskih ciljeva, usklađivanje postojećih lijekova s novim indikacijama bolesti i smanjuje potencijalna sumnja u sigurnost lijekova u razvoju. Razvrstavanje specifičnih proteina bitno je u obradi rezultata proteomičke analize. U ovom radu korišten je sustav klasifikacije PANTHER i baza STRING za predviđanje interakcija proteina. Sustav klasifikacije PANTHER (Protein ANalysis THrough Evolutionary Relationships) je dizajniran je za klasifikaciju proteina (i njihovih gena) kako bi se olakšala analiza velike propusnosti. STRING je baza poznatih i računalno predviđenih interakcija protein-protein iz interakcija združenih iz drugih (primarnih) baza podataka. Za obradu podataka korišteni su rezultati proteomičke analize objavljenih radova u području hepatotoksičnosti. Korišteni programi razvrstali su proteine prema njihovim funkcijama, procesu u kojima sudjeluju, položaju i putu u stanici, smjestili u izravne i neizravne funkcionalne asocijacije. Time je omogućena obrada rezultata proteomičke analize kroz dubinsku analizu komplementa svih njegovih proteina, proteoma jetre.

proteomička analiza ; jetra ; hepatotoksičnost ; sustav klasifikacije proteina PANTHER, STRING baza

nije evidentirano