hrvatski

Potencijalne terapijske biomolekule probiotičkih sojeva autohtonih bakterija mliječne kiseline

Iz 30 uzoraka majčinog mlijeka i fecesa dojenčadi, izolirana je DNA te je provedeno sekvenciranje V1-V3 regije 16S rRNA gena. Taksonomskom analizom dobivenih sekvenci, utvrđena je korelacija u sastavu mikrobioma mlijeka majki i fecesa njihove dojenčadi. Hijerarhijskom klaster analizom RAPD-PCR elektroforetskih profila 100 bakterijskih sojeva izoliranih iz majčinog mlijeka, odabrano je 28 genetički različitih sojeva. SDS-PAGE analizom je po prvi puta ustanovljena prisutnost S-proteina kod 4 soja izolirana iz majčinog mlijeka, a PCR analizom je kod 6 Lactobacillus plantarum sojeva potvrđena prisutnost 3 gena (plnJ, plnA i plnEF) koji sudjeluju u biosintezi bakteriocina. Detaljno su okarakterizirani i probiotički sojevi producenti potencijalnih terapijskih biomolekula, Lb. brevis SF9B i Lb. plantarum SF9C, izolirani iz rasola kiselog kupusa. Analizom cijelog genoma soja SF9B, pronađena su 3 gena (slpB, slp i slpD) koji kodiraju S- proteine. LC-MS analizom proteinskih vrpci dobivenih SDS-PAGE i 2D-EF, ustanovljena je ekspresija samo jednog, slpB gena. Sekundarna struktura izoliranog S-proteina je pretpostavljena PSIPRED metodom, a tercijarna pomoću I-TASSER servera. Potvrđeno je da soj SF9C sadrži 9 gena koji kodiraju za bakteriocine. Tercijarne strukture plantaricina PlnJK i PlnEF pretpostavljene su pomoću SWISS- MODEL servera, a fizikalno-kemijska svojstva njihovih α-uzvojnica HeliQuest serverom. DGGE analizom i analizom fekalnog mikrobioma, potvrđen je in vivo utjecaj primjene združene kulture sojeva SF9B i SF9C na sastav fekalnog mikrobioma 18 štakora.

probiotici ; S-proteini ; bakteriocini ; mikrobiom majčinog mlijeka ; mikrobiom fecesa dojenčadi

nije evidentirano