hrvatski

Genetska raznolikost SARS-CoV-2 na području Hrvatske

SARS-CoV-2 kao RNA virus s velikim genomom podložan je učestalim mutacijama tijekom replikacije. Između beznačajnih i pogubnih mutacija nalaze se i one koje virusu donose selektivnu prednost. Krajem 2020. i početkom 2021. godine pojavile su se varijante koje se čine zaraznije nego postojeći sojevi, izbjegavaju imunološki odgovor i izazivaju težu kliničku sliku. Tri varijante koje su na određenim zemljopisnim područjima brzo postale dominantne te nazvane varijantama od značaja (VOC ; eng. Variant of Concern) su: B.1.1.7, B.1.351 i P.1 Do današnjeg dana ECDC prati još dvije VOC: B.1.1.7+E484K i B.1.617.2 U svrhu praćenja epidemiološke situacije, sukladno preporukama ECDC provedeno je sekvenciranje cijelog genoma (WGS, eng. Whole Genome Sequencing) na 5-10% SARS- CoV-2 pozitivnih uzoraka u Hrvatskoj. WGS se provodi na tjednoj dinamici od 09.02.2021. godine. Dobivene sekvence se učitavaju u GISAID bazu podataka koja izolate kategorizira u filogenetske grane ovisno o jednostrukim polimorfizmima prisutnima u genomu. Do kraja svibnja 2021. godine poslana su 5734 uzorka, od čega je uspješno sekvencirano 4745. Između prva dva vala epidemije dominirali su virusni sojevi G, GR i GV grana, a pojačana prisutnost sojeva iz GRY grane označila je početak trećeg vala epidemije u Hrvatskoj. Dobiveni rezultati sekvenciranja pokazuju značajan porast u udjelu prisutnosti VOC B.1.1.7 od 21.23% u prvom tjednu WGS ispitivanja, do 98, 4% u zadnjem tjednu svibnja 2021. godine. S druge strane, sljedeća VOC B.1.351 GH grane dokazana je sporadično, u 19 uzoraka koji su većinom povezani s putovanjima izvan Hrvatske te njihovim bliskim kontaktima. Pri kraju trećeg vala pojavila se varijanta B.1.617.2, koja je dokazana u dva uzorka.

SARS-CoV-2 ; linije ; Hrvatska

nije evidentirano