hrvatski

Cijanobakterije na morskim kornjačama: istraživanje raznolikosti metodom metabarkodinga

Cijanobakterije su autotrofni prokariotski organizmi koje nalazimo na širokom rasponu staništa. Poznato je da su jedne od prvih kolonizatora podvodnih površina. Iako su morske bentičke cijanobakterije bitan dio morskih zajednica, manje su istraživane od planktonskih vrsta. O epizojskim morskim cijanobakterijama ima pogotovo malo podataka. Sve veći broj istraživanja biofilmova na morskim kornjačama je pokazao njihovu raznolikost i unikatnost u odnosu na ostale biofilmove pod morem. Oklop i koža morskih kornjača predstavljaju stanište različitim makro epibiontima (rakovi vitičari, zelene i crvene alge) i mikro epibiontima (dijatomeje, cijanobakterije, proteobakterije, praživotinje). Epizojske cijanobakterije na morskim kornjačama su u istraživanjima zanemarene te se jako malo zna o njihovoj morfologiji i filogeniji. Za naše preliminarno istraživanje cijanobakterija u mikrobnim obraštajima kornjača koristili smo sekvenciranje amplikona za 16S rRNA. Korišteni su uzorci oklopa i kože od 54 glavate želve (Caretta caretta) sakupljeni u 2018. i 2019. godini iz Jadranskog mora (Hrvatska i Italija) te iz Jonskog mora (Grčka). Zabilježeno je više od 20 cijanobakterijskih porodica u tim uzorcima, a četiri najbrojnije porodice su Phormidesmiaceae, Paraspirulinaceae, Xenococcaceae i Limnotrichaceae. Također je pronađen veliki broj cijanobakterijskih sekvenci koje se putem metabarkodinga ne mogu identificirati dalje od razine razreda jer sekvence tih cijanobakterija nisu pohranjene u bazama podataka. Kako bi doprinijeli smanjenju broja neidentificiranih sekvenci, plan je izolirati cijanobakterijske kulture iz obraštaja kornjača. Koristit će se kombinirani morfološki i molekularni pristup istraživanja tih kultura, te će njihove sekvence biti pohranjene u bazama podataka. To će doprinijeti preciznijoj identifikaciji cijanobakterija putem DNA barkodinga i metabarkodinga u budućnosti. Također, ova istraživanja će doprinijeti sveukupnom boljem razumijevanju odnosa cijanobakterija i njihovih domaćina, glavatih želvi.

cijanobakterije, glavata želva, 16S rRNA gen

nije evidentirano