hrvatski

Usporedba metoda analize krivulje taljenja visoke rezolucije (HRM) i krivulje taljenja pomoću FRET hibridizacijskih proba za detekciju insercije TA u promotoru gena UGT1A1

Gen UGT1A1 kodira sintezu enzima bilirubin-UGT koji sudjeluje u glukuronidaciji bilirubina te metabolizmu nekih lijekova. Divlji tip alela ima 6 TA ponavljanja u promotorskoj regiji gena. Najčešća polimorfna varijanta sa 7 TA ponavljanja uzrok je Gilbertovog sindroma. Real-time PCR metodama kao što su analiza krivulje taljenja visoke rezolucije (HRM) te analiza krivulje taljenja pomoću FRET hibridizacijskih proba moguća je genotipizacija UGT1A1(TA)n polimorfizma. U postupku dijagnostike važno je imati pouzdanu, specifičnu, reproducibilnu i robusnu metodu, kojom se do rezultata dolazi u što kraćem vremenskom roku, uz što niže financijske troškove. U ovom istraživanju ispitane su i uspoređene karakteristike specifičnost, pouzdanost, efikasnost, reproducibilnost, robusnost, financijski troškovi te vremenski utrošak za FRET i HRM metodu.Dokazano je da su obje metode pouzdane, specifične i efikasne za genotipizaciju UGT1A1(TA)n polimorfizma.Utvrđeno je da je metoda HRM analize 2, 5 puta jeftinija od analize krivulje taljenja pomoću FRET hibridizacijskih proba, dok je za analizu rezultata kod HRM metode potrebno utrošiti malo više vremena. Nadalje, utvrđeno je da je HRM metoda prikladnija za detekciju heterozigotnog TA 6/7 genotipa.

analiza krivulja taljenja ; FRET hibridizacijske probe ; gen UGT1A1 ; HRM

nije evidentirano