Molekularna karakterizacija kvazivrsta hrvatskih izolata virusa hepatitisa A (CROSBI ID 435334)
Ocjenski rad | diplomski rad
Podaci o odgovornosti
Kuzle, Josipa
Černi, Silvija ; Grgić, Ivana
hrvatski
Molekularna karakterizacija kvazivrsta hrvatskih izolata virusa hepatitisa A
Virus hepatitisa A (HAV) jednolančani je RNA virus pozitivnog smisla iz porodice Picornaviridae i glavni uzročnik akutne bolesti jetre u svijetu. Broj zaraženih u Hrvatskoj porastao je u posljednjih nekoliko godina. Kao i ostali virusi s RNA-genomom, HAV ima tendenciju nakupljanja mutacija zbog brze replikacije i nemogućnosti popravaka pogrešaka enzima RNA- polimeraze ovisne o RNA. Zbog toga virusni izolati sadrže velik broj mutanata/genomskih varijanti, koje zajedno tvore tzv. kvazivrste. Varijante unutar kvazivrste mogu se razlikovati u svom patogenom potencijalu, no rutinske analize ne uključuju njihovu karakterizaciju. Gotovo nema literaturnih podataka o genskoj raznolikosti varijanti virusa HAV unutar pojedinih izolata te o prirodi prisutnih mutacija. Stoga je cilj ovog rada bio molekularno karakterizirati genomske varijante virusa HAV razdvojene kloniranjem, podrijetlom iz 13 pacijenata. Analizom hipervarijabilne regije genoma VP2-2A svakog uzorka obuhvaćeno je po 20 varijanti, koje su identificirane metodom SSCP i sekvencirane. Usporedbom virusnih mutanata s dominantnom populacijskom varijantom svakog uzorka utvrđena je brojnost i priroda mutacijskih događaja. Rezultati ukazuju na česte mutacijske događaje nasumično pozicionirane unutar analizirane regije. Detektiran je i visok postotak nesinonimnih mutacija, što može imati utjecaj na biološke karakteristike virusa. Kod pacijenata koinficiranih virusom HIV zabilježen je manji broj promjena na nukleotidnoj i aminokiselinskog razini u odnosu na ostale pacijente.
mutacije, populacijska struktura, sekvenciranje, SSCP
nije evidentirano
engleski
Molecular characterization of Hepatitis A virus quasispecies from Croatian isolates
nije evidentirano
mutations, population structure, sequencing, SSCP
nije evidentirano
Podaci o izdanju
57
28.09.2020.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet, Zagreb
Zagreb