IN VITRO TEST SPAJANJA KRAJEVA DNA (engl. in vitro DNA end-joining assay) (CROSBI ID 435007)
Ocjenski rad | sveučilišni preddiplomski završni rad
Podaci o odgovornosti
Ema Bellulovich
Šamanić, Ivica
hrvatski
IN VITRO TEST SPAJANJA KRAJEVA DNA (engl. in vitro DNA end-joining assay)
U ovome radu opisan je in vitro test spajanja krajeva DNA, biokemijsko-molekularna metoda pomoću koje, koristeći stanični ekstrakt ili pročišćene proteine iz tkiva s ciljanom inaktivacijom ključnih gena uključenih u pojedine mehanizme popravka oštećenja DNA, možemo detektirati vrstu popravka dvolančanih lomova DNA. In vitro određivanje pojedine vrste mehanizma popravka spajanjem krajeva DNA (engl. end- joining) omogućuje kombinirani par polinukleotidnih sekvenci DNA koje završavaju slobodnim dvolančanim krajevima s mogućnošću ponovnog spajanja. Nakon inkubacije oštećene plazmidne DNA sa staničnim ekstraktima biljnog tkiva i na temelju analize strukture rekonstruiranih krajeva DNA elektroforezom u gelu agaroze, te određivanja slijeda nukleotida na mjestu spajanja pomoću reakcije PCR i sekvenciranja, moguće je procijeniti s kojom točnošću su se krajevi DNA povezali. Iz toga se može zaključiti radi li se o preciznom popravku „klasičnim“ nehomolognim spajanjem krajeva DNA (NHEJ), alternativnom načinu popravka krajeva (alt-EJ), ili pak mehanizmu spajanja krajeva potpomognutom mikrohomologijom (MMEJ), odnosno identificirati ključne proteine za pojedine procese.
in vitro test spajanja DNA krajeva, dvolančani lom DNA, stanični ekstrakt biljnog tkiva, plazmidi, restrikcijski enzimi, elektroforeza, NHEJ, MMEJ
nije evidentirano
engleski
IN VITRO DNA END-JOINING ASSAY
nije evidentirano
in vitro DNA end-joining assay, double-strand DNA breaks (DSBs), plasmid DNA, restriction endonuclease, electrophoresis, NHEJ, MMEJ
nije evidentirano
Podaci o izdanju
39
18.09.2020.
obranjeno
Podaci o ustanovi koja je dodijelila akademski stupanj
Prirodoslovno-matematički fakultet u Splitu
Split