hrvatski

Primjena Pythona u kemijskom modeliranju

Python je idealan programski jezik za učenje programiranja, a programi pisani u Pythonu kraći su i jednostavniji u usporedbi s ostalim programskim jezicima. Zbog brojnih biblioteka gotovih programskih cjelina koje se mogu po potrebi pozivati u programu i besplatnog koda postao je popularan u istraživanjima i razvoju u raznim područjima, pa tako i u kemiji i farmaciji. Postoje brojni primjeri uporabe programskoga jezika Python u računalnoj kemiji koje primjenjuju i pojedine farmaceutske kompanije. Na jednostavnom primjeru modeliranja topljivosti skupa organskih molekula u vodi prikazana je uporaba Pythona, te mogućnosti koje nudi taj programski jezik. Model se temelji na algoritmima izbora najbolje varijable (kao i rangiranja varijabli na temelju kvalitete korelacije s topljivošću molekula) iz Pythonovih modula scipy i scikit. Deskriptori su izračunati pomoću kemoinformatičkog modula RDkit polazeći od strukture molekule u obliku SMILES koja se konvertira u MOL oblik.

molekulsko modeliranje ; Python ; programiranje ; topljivost molekula, Python, programski jezik ; topljivost molekula ; modul scipy ; scikit ; SMILES ; RDkit

nije evidentirano