Pretražite po imenu i prezimenu autora, mentora, urednika, prevoditelja

Napredna pretraga

Pregled bibliografske jedinice broj: 1037722

Reakcijski mehanizam transaciliranja ferocenoil-purina. Računalna studija


Toma, Mateja; Božičević, Lucija; Tandarić, Tana; Vianello, Robert; Šakić, Davor; Vrček, Valerije
Reakcijski mehanizam transaciliranja ferocenoil-purina. Računalna studija // 8. Simpozij studenata farmacije i medicinske biokemije, FARMEBS 2019. - Knjiga Sažetaka / Bojić, Mirza ; Somborac Bačura, Anita (ur.).
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Farmaceutsko-biokemijski fakultet, 2019. str. 34-34 (poster, domaća recenzija, sažetak, ostalo)


CROSBI ID: 1037722 Za ispravke kontaktirajte CROSBI podršku putem web obrasca

Naslov
Reakcijski mehanizam transaciliranja ferocenoil-purina. Računalna studija
(Reaction mechanism of transacylation of ferrocenoyl-purines. A computational study)

Autori
Toma, Mateja ; Božičević, Lucija ; Tandarić, Tana ; Vianello, Robert ; Šakić, Davor ; Vrček, Valerije

Vrsta, podvrsta i kategorija rada
Sažeci sa skupova, sažetak, ostalo

Izvornik
8. Simpozij studenata farmacije i medicinske biokemije, FARMEBS 2019. - Knjiga Sažetaka / Bojić, Mirza ; Somborac Bačura, Anita - Zagreb : Sveučilište u Zagrebu, Farmaceutsko-biokemijski fakultet, 2019, 34-34

ISBN
978-953-8273-01-8

Skup
8. Simpozij studenata farmacije i medicinske biokemije, FARMEBS 2019.

Mjesto i datum
Zagreb, Hrvatska, 01.06.2019

Vrsta sudjelovanja
Poster

Vrsta recenzije
Domaća recenzija

Ključne riječi
ferocenoil-purinski konjugati ; transaciliranje ; računalna studija ; DFT model ; molekularna dinamika
(ferrocenoyl-purine conjugates ; transacylation ; computational study ; DFT method ; molecular dynamics)

Sažetak
Ferocenoil-purini su organometalni spojevi koji sadrže redoks aktivni ferocenski sustav i nukleobazu. Reakcijom purinskog aniona i ferocenoil-klorida nastaju dva izomera, N7 i N9, čiji udio ovisi o C6-supstituentu purinskog prstena. U polarnim aprotičnim otapalima kao što su DMSO i DMF dolazi do spontanog transaciliranja oba izomera do uspostave ravnotežnog stanja. Reakcijski mehanizam transaciliranja ferocenoil-purinskih derivata u DMSO (Slika 1.) istražen je računalnim metodama: kvantno-kemijskim (DFT model) pristupom i simulacijama molekulske dinamike (MD). Transferocenoiliranje započinje nukleofilnim napadom molekule DMSO na karbonilnu skupinu u N7 (ili N9) položaju nakon čega slijedi transfer acilne skupine prema SN2 mehanizmu. DFT metodom locirane su stacionarne točke (minimumi i prijelazna stanja), a uvođenje dviju eksplicitnih molekula DMSO provedeno je stohastičkom procedurom. Izračunate energijske barijere za transferocenoiliranje kod adenina i 6-metilpurina na SMD-M06L/6-311+G(d, p)/SDD razini iznose ΔGcalc = 107, 9 kJ/mol i ΔGcalc = 108, 2 kJ/mol te su u dobrom slaganju s eksperimentalno dobivenim vrijednostima (ΔGexp ≈ 104 i 112 kJ/mol). Eksperimentalne vrijednosti energijskih barijera određene su kinetičkim mjerenjima pomoću NMR spektroskopije. Za O- i NH-benzilne derivate očekivane su više energijske barijere kao posljedica steričkog ometanja C6-supstituenta. Rezultati dobiveni MD simulacijama pokazuju postojanost vodikove veze između N7-C=O i C6-NH-CH2Ph te C6-NH2 koje povećavaju elektrofilnost karbonilnog ugljika i tako ubrzavaju reakciju, kao i statistički učestalije pojavljivanje molekule DMSO-a u blizini reaktivnog karbonilnog ugljika u slučaju NH-CH2Ph derivata.

Izvorni jezik
Hrvatski

Znanstvena područja
Kemija, Farmacija



POVEZANOST RADA


Projekti:
HRZZ-IP-2016-06-1137 - Kvantno-kemijski dizajn, priprava i biološka svojstva organometalnih derivata nukleobaza (OrDeN) (Vrček, Valerije, HRZZ - 2016-06) ( POIROT)

Ustanove:
Farmaceutsko-biokemijski fakultet, Zagreb,
Institut "Ruđer Bošković", Zagreb

Profili:

Avatar Url Mateja Toma (autor)

Avatar Url Valerije Vrček (autor)

Avatar Url Davor Šakić (autor)

Avatar Url Tana Tandarić (autor)

Avatar Url Robert Vianello (autor)

Citiraj ovu publikaciju

Toma, Mateja; Božičević, Lucija; Tandarić, Tana; Vianello, Robert; Šakić, Davor; Vrček, Valerije
Reakcijski mehanizam transaciliranja ferocenoil-purina. Računalna studija // 8. Simpozij studenata farmacije i medicinske biokemije, FARMEBS 2019. - Knjiga Sažetaka / Bojić, Mirza ; Somborac Bačura, Anita (ur.).
Zagreb: Sveučilište u Zagrebu, Farmaceutsko-biokemijski fakultet, 2019. str. 34-34 (poster, domaća recenzija, sažetak, ostalo)
Toma, M., Božičević, L., Tandarić, T., Vianello, R., Šakić, D. & Vrček, V. (2019) Reakcijski mehanizam transaciliranja ferocenoil-purina. Računalna studija. U: Bojić, M. & Somborac Bačura, A. (ur.)8. Simpozij studenata farmacije i medicinske biokemije, FARMEBS 2019. - Knjiga Sažetaka.
@article{article, year = {2019}, pages = {34-34}, keywords = {ferocenoil-purinski konjugati, transaciliranje, ra\v{c}unalna studija, DFT model, molekularna dinamika}, isbn = {978-953-8273-01-8}, title = {Reakcijski mehanizam transaciliranja ferocenoil-purina. Ra\v{c}unalna studija}, keyword = {ferocenoil-purinski konjugati, transaciliranje, ra\v{c}unalna studija, DFT model, molekularna dinamika}, publisher = {Sveu\v{c}ili\v{s}te u Zagrebu, Farmaceutsko-biokemijski fakultet}, publisherplace = {Zagreb, Hrvatska} }
@article{article, year = {2019}, pages = {34-34}, keywords = {ferrocenoyl-purine conjugates, transacylation, computational study, DFT method, molecular dynamics}, isbn = {978-953-8273-01-8}, title = {Reaction mechanism of transacylation of ferrocenoyl-purines. A computational study}, keyword = {ferrocenoyl-purine conjugates, transacylation, computational study, DFT method, molecular dynamics}, publisher = {Sveu\v{c}ili\v{s}te u Zagrebu, Farmaceutsko-biokemijski fakultet}, publisherplace = {Zagreb, Hrvatska} }




Contrast
Increase Font
Decrease Font
Dyslexic Font