hrvatski

Multigenska analiza patosustava fitoplazme ribosomske skupine 16SrXII-A

Fitoplazme (rod 'Ca. Phytoplasma') su kozmopolitni obligatorni paraziti bez stanične stijenke koji tvore monofiletsku bakterijsku skupinu unutar razreda Mollicutes. Istraživanje fitoplazmi otežano je nemogućnošću uzgoja u kulturi in vitro. Imaju vrlo kompleksan životni ciklus koji može uključivati više biljaka- domaćina i kukaca-vektora, a uzrokuju mnoge ekonomski značajne bolesti poljoprivrednih kultura u cijelom svijetu. U Europi su jako raširene žutice vinove loze koje uzrokuju fitoplazme flavescence dorée (FD) i bois noir (BN ; Ca. 'Phytoplasma solani'). Cilj ovog diplomskog rada bila je multigenska tipizacija izolata fitoplazme analizom 16S rRNA gena te gena tufB (elongacijski faktor Tu), vmp1 (varijabilni membranski protein), secY (dio sekretornog sustava translokaze) i stamp, za koje postoji indikacija da bi mogli biti važni kod razlikovanja epidemioloških karakteristika različitih sojeva. U analizu su uključeni uzorci kukaca-vektora vrste Hyalestes obsoletus, simptomatični uzorci Vitis vinifera te asimptomatični uzorci Convolvulus arvensis. Analizirani su fragmenti gena za 16S rRNA, tufB, secY, vmp1 i stamp za koje se smatra da su važni kod utvrđivanja epidemiološkog potencijala različitih fitoplazmatskih sojeva. Fragmenti su umnoženi lančanom reakcijom polimerazom, ispitani RFLP analizom te sekvencirani i obrađeni filogenetskom analizom. Pokazano je da je tufB konzerviraniji od membranskih proteina. Svi geni su se pokazali kao dobri markeri za razlučivanje sojeva i bolje razumijevanje epidemiologije fitoplazmoza.

žutice vinove loze, BN fitoplazma, MLST, tufB, secY, vmp, stamp

nije evidentirano